Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms