Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms