Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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DNASE1L3Q13609 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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DNASE1L3Q13609 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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DNASE1L3Q13609 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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DNASE1L3Q13609 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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DNASE1L3Q13609 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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DNASE1L3Q13609 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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DNASE1L3Q13609 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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DNASE1L3Q13609 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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