Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNW1Q13573 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms