Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms