Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRQ13535 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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