Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TUBB3Q13509 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TUBB3Q13509 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TUBB3Q13509 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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