Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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