Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SCGB2A2Q13296 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SCGB2A2Q13296 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SCGB2A2Q13296 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SCGB2A2Q13296 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SCGB2A2Q13296 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SCGB2A2Q13296 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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