Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME3Q13232 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms