Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CHAF1BQ13112 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CHAF1BQ13112 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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