Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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