Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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BNIP3Q12983 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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BNIP3Q12983 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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BNIP3Q12983 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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