Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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