Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms