Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms