Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
LRP1Q07954 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms