Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN11Q06124 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms