Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSPL2Q05D32 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms