Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms