Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREMQ03060 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms