Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms