Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms