Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms