Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POU5F1Q01860 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms