Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms