Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTCQ00610 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms