Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK3Q00526 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms