Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms