Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NUP107P57740 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NUP107P57740 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NUP107P57740 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms