Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms