Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THOP1P52888 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms