Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HK3P52790 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HK3P52790 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HK3P52790 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HK3P52790 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HK3P52790 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HK3P52790 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HK3P52790 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HK3P52790 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HK3P52790 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HK3P52790 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms