Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF6P49848 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF6P49848 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms