Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RECQLP46063 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RECQLP46063 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RECQLP46063 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RECQLP46063 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RECQLP46063 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RECQLP46063 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RECQLP46063 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RECQLP46063 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RECQLP46063 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RECQLP46063 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RECQLP46063 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms