Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMPOP42166 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMPOP42166 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMPOP42166 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMPOP42166 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms