Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MDH1P40925 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MDH1P40925 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MDH1P40925 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms