Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms