Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms