Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GTF2E2P29084 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms