Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM21P19474 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms