Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XBP1P17861 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XBP1P17861 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XBP1P17861 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms