Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DESP17661 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DESP17661 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DESP17661 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DESP17661 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DESP17661 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DESP17661 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DESP17661 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DESP17661 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms