Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms