Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms