Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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