Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms