Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOP08100 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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