Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX7O95931 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX7O95931 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX7O95931 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.1 ms