Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C6orf47O95873 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C6orf47O95873 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms